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豬鈣蛋白酶抑制蛋白基因單體型的分離鑒定方法

時(shí)間:2026-04-08    作者:admin 點(diǎn)擊: ( 2 ) 次

【摘要】 本發(fā)明涉及一種豬鈣蛋白酶抑制蛋白基因單體 型的分離鑒定方法,屬于家畜分子生物學(xué)技術(shù)領(lǐng)域。其步驟包 括,提取豬的基因組DNA,鈣蛋白酶抑制蛋白基因的PCR擴(kuò) 增,擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)性檢測(cè),單體型的構(gòu)建及其與豬肉肉質(zhì)性 狀的相關(guān)性分析。本發(fā)明的特征是分離鑒定出兩個(gè)新的豬鈣蛋 白酶抑制蛋白基因的單體型H2121和H1211。本發(fā)明利用鈣蛋 白酶抑制蛋白基因的單體型與豬肉肉質(zhì)性狀顯著相關(guān)的特性, 為豬的標(biāo)記輔助選種和選配提供了新的分子標(biāo)記方法。 【專(zhuān)利類(lèi)型】發(fā)明申請(qǐng) 【申請(qǐng)人】上海交通大學(xué) 【申請(qǐng)人類(lèi)型】學(xué)校 【申請(qǐng)人地址】200240上海市閔行區(qū)東川路800號(hào) 【申請(qǐng)人地區(qū)】中國(guó) 【申請(qǐng)人城市】上海市 【申請(qǐng)人區(qū)縣】閔行區(qū) 【申請(qǐng)?zhí)枴緾N200610028881.3 【申請(qǐng)日】2006-07-13 【申請(qǐng)年份】2006 【公開(kāi)公告號(hào)】CN1904065A 【公開(kāi)公告日】2007-01-31 【公開(kāi)公告年份】2007 【IPC分類(lèi)號(hào)】C12Q1/68; C12N15/10 【發(fā)明人】潘玉春; 王起山; 孫立彬; 李婧; 白春艷 【主權(quán)項(xiàng)內(nèi)容】1、一種豬鈣蛋白酶抑制蛋白基因單體型的分離鑒定方法,其特征在于包括 如下步驟: 1)采集豬耳組織,利用常規(guī)的苯酚/氯仿抽提方法提取基因組DNA; 2)針對(duì)鈣蛋白酶抑制蛋白基因的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)200A/G、1187C/T,設(shè)計(jì) 鈣蛋白酶抑制蛋白基因特異性引物,進(jìn)行PCR反應(yīng),得到擴(kuò)增產(chǎn)物1;其中, 核苷酸編號(hào)基于GenBank索引號(hào):AY594692,所述的基因特異性引物具有 5`-AAAGCCTACCCACGCACT-3`和5-GCAGATACACCAGTAACAGAA A-3`的序列,所述的擴(kuò)增產(chǎn)物1長(zhǎng)度為100~3000bp,且含有AY594692的 200位和1187位; 3)針對(duì)鈣蛋白酶抑制蛋白基因的單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)998A/G、1189C/T,設(shè)計(jì) 鈣蛋白酶抑制蛋白基因特異性引物,進(jìn)行PCR反應(yīng),得到擴(kuò)增產(chǎn)物2;其中, 核苷酸編號(hào)基于GenBank索引號(hào):AY522920,所述的基因特異性引物具有 5`-AGTGATGACAAAAAACTTGAC-3`和5`-CTCATCCTTATCCAAGAGA TTC-3`的序列,所述的擴(kuò)增產(chǎn)物2長(zhǎng)度為100~3000bp,且含有AY522920 的998位和1189位; 4)檢測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物1的200位和1187位和擴(kuò)增產(chǎn)物2的998位和1189位的多態(tài) 性; 5)構(gòu)建單體型,針對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物的多態(tài)性用統(tǒng)計(jì)分析的方法共分離鑒定出4種單 體型H1211,H2121,H2122,H2221; 6)通過(guò)偏回歸分析方法確定與肉質(zhì)量性狀相關(guān)的單體型,其中,單體型H2121 與肌肉嫩度顯著正相關(guān),單體型H1211與肌內(nèi)脂肪含量顯著正相關(guān),攜帶有 上述單體型H2121的個(gè)體和單體型H1211個(gè)體的豬肉肉質(zhì)性狀顯著優(yōu)于含有 其它單體型的個(gè)體; 其中所述的單體型H2121在GenBank索引號(hào)AY59469的200A/G、1187C/T 和GenBank索引號(hào)AY522920的998A/G、1189C/T位點(diǎn)的單核苷酸分別為G、 C、G、C;所述的單體型H1211即在GenBank索引號(hào)AY59469的200A/G、1187C/T 和GenBank索引號(hào)AY522920的998A/G、1189C/T位點(diǎn)的單核苷酸分別為A、 T、A、C。 (macrodatas.cn) 【當(dāng)前權(quán)利人】上海交通大學(xué) 【當(dāng)前專(zhuān)利權(quán)人地址】上海市閔行區(qū)東川路800號(hào) 【統(tǒng)一社會(huì)信用代碼】1210000042500615X0 【引證次數(shù)】2.0 【被引證次數(shù)】1 【他引次數(shù)】2.0 【被他引次數(shù)】1.0 【家族引證次數(shù)】2.0 【家族被引證次數(shù)】1

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